短程蒸馏又称分子蒸馏，是近年来发展迅速的一种分离技术，可以解决热敏性和高沸点物质的分离问题。称为蒸馏，但原理不同：普通蒸馏是根据沸点的差异，而分子蒸馏是根据分子平均自由程。

分子蒸馏应用于石油化工、食品、医药、香精香料、精细化工等领域，尤其是天然产物和热敏性物质的分离纯化。例如，提炼精制鱼油。鱼油中的EPA和DHA（这就是所谓的脑黄金，很多儿童产品都有这种成分）主要是从海洋鱼油中提取的。分子蒸馏鱼油产品色泽好，气味纯正，质量好，氧化值低。此外，天然色素、天然维生素和天然挥发性精油的提取采用短程蒸馏。在石油化工领域，可用于合成润滑基础油的精炼处理，也可用于油品分析，用于减压蒸馏油的拉深领域。在医药领域，用于药物或中间体的纯化（例如4-甲氧基乙酰乙酸甲酯的纯化，抗HIV-1药物dulutvir的关键中间体）。

分子蒸馏技术与其他先进技术的结合，可以解决更多的实际问题。然而，对内部流体力学和分子蒸馏装置中传质传热机理的研究还不够完善。需要做更多的研究来建立相应的数学模型，为分子蒸馏技术解决实际问题提供理论基础。同时，要大力发展低成本、高性能的分子蒸馏设备，使短程蒸馏技术实现规模化工业化应用。